در پی مصوبه جدید شورای عالی انقلاب فرهنگی، صدور مجوزهای طب سنتی و مکمل و تایید مجوزهای فعلی؛ بار دیگر به وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی واگذار شد.
طبق این مصوبه که در جلسه ۹۱۴ شورای عالی انقلاب فرهنگی به تصویب رسید و با امضای رئیس‌جمهور و رئیس شورا به شماره ۱۴۰۴/۷۸۷ ابلاغ شده، از این پس تنها مرجع صدور مجوز برای فعالیت‌های آموزشی، پژوهشی و حرفه‌ای در زمینه طب سنتی، وزارت بهداشت خواهد بود. همچنین، تبصره ۲ ماده‌واحده‌ای که پیش‌تر در جلسه ۸۹۸ شورا مصوب شده بود، لغو شده و دیگر نهادها، از جمله ستادهای مرتبط، نقشی در این فرآیند نخواهند داشت. بر این اساس، متقاضیان تأسیس یا ادامه فعالیت در این حوزه باید صرفاً از طریق وزارت بهداشت اقدام کنند.
بر اساس این تصمیم جدید، تنها وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی مسئول مجوزهای طب سنتی خواهد بود. به این ترتیب، هیچ نهاد دیگری، از جمله ستادهای مربوطه، حق دخالت در این فرآیند را ندارند. در نتیجه، متقاضیانی که قصد تأسیس یا ادامه فعالیت در بخش‌های آموزشی، پژوهشی و ارائه خدمات تخصصی طب سنتی و مکمل را دارند، باید منحصراً درخواست‌های خود را از طریق کانال‌های رسمی وزارت بهداشت ثبت و پیگیری کنند.